Resultados según su relevancia en PubMed


Pubmed siempre nos ha dado varias opciones a la hora de ordenar los resultados de nuestras búsquedas. Desde el link Display Settings teníamos la opción de ver los resultados en un formato determinado, un número determinado de elementos por página o bien ordenarlos según habían sido añadidos recientemente [a Pubmed], fecha de publicación, primer autor, último autor, revista o título.

display settings

(ANTES)

Captura de pantalla 2013-10-25 a la(s) 12.17.44

(AHORA)

Ahora ya tenemos una nueva opción para ordenar los resultados de nuestras búsquedas: por relevancia. Esta ordenación se basa en un algoritmo que analiza todas las citas de Pubmed que incluyen el término de búsqueda. Para cada estrategia de búsqueda se calcula el peso (la importancia) dependiendo de cuántas veces aparece el término de búsqueda y los campos en los que aparece. Además, los artículos más recientes obtienen una puntuación mayor puesto que se presuponen con información más actualizada.

Recordad que si queréis que estas opciones de visualización de resultados aparezcan siempre a vuestro gusto, podéis modificarlo desde vuestro perfil de My NCBI:

Captura de pantalla 2013-10-25 a la(s) 12.14.58

http://pubmed.com
http://pubmed.com
http://pubmed.com

¿Qué haríamos sin PubMed?


Shudown Pubmed

 

MEDLINE es la principal base de datos de medicina de la Biblioteca Nacional de Medicina de EEUU (NLM). Desde 1997, gracias a la Freedom of Information Act (FOIA) -ley federal americana que permitía la divulgación total o parcial de documentos e información controlada hasta ese momento por el gobierno de EEUU- se puede acceder de forma libre y gratuita a esta base de datos a través de PubMed. La NLM da acceso no sólo a PubMed, sino a otras muchas bases de datos relacionadas, como MeSH, ClinicalTrials.gov o MedlinePlus. Estoy segura que habéis utilizado más de una de ellas y más de una vez.

PubMed se ha convertido casi en la herramienta indispensable para ayudar en el trabajo diario no sólo del personal sanitario, sino de los bibliotecarios de ciencias de la salud que la usan a diario para ayudar a sus usuarios a mantenerse informados y con la información más relevante y actualizada. ¿Qué pasaría si PubMed desapareciera? Como muchos ya sabréis, los recortes en el gobierno de EEUU han provocado el cierre de muchas de estas instituciones. Otras, como la NLM, se quedan bajo mínimos, es decir, no cierra pero hasta nueva orden no actualizará su información. Y nos surgen muchas dudas:

– ¿Cómo vamos a buscar de forma eficiente información médica actualizada?

– A la hora de realizar una bibliografía, ¿podremos asegurar que hemos consultado todo y que aparece adecuadamente reflejado en nuestro paper, artículo, tesis…?

– Aquellas instituciones que no puedan permitirse la suscripción de otras bases de datos o fuentes de información de pago, ¿cómo garantizarán la formación de sus profesionales? y esto me lleva a una pregunta más peliaguda ¿se resentirá la calidad de la práctica clínica?

– Las revisiones sistemáticas serán más y más complicadas de llevar a cabo con todas las garantías de estar recuperando toda la información relativa al tema de investigación.

– Al igual que Pubmed, otras bases de datos especializadas y de gran interés para la comunidad investigadora y sanitaria dejarán de actualizarse, por lo que la falta de calidad y exhaustividad serán un punto en común en la mayoría de los trabajos.

En el Boletín Técnico de la NLM no aparece aún ninguna nota sobre estos hechos, aunque es probable que no se actualice hasta nueva orden. La única información que disponemos de primera mano es el mensaje que aparece en la portada de PubMed y otras bases de datos de la NLM:

pubmed down

 

 

Sinceramente, espero que esta situación se revierta y volvamos a contar con la actualización diaria de estas herramientas tan importantes para nuestro trabajo diario.

Mejoras en las búsquedas guardadas de My NCBI


Próximamente, My NCBI permitirá modificar los términos de una búsqueda cuando queramos guardarla.

Las búsquedas que hacemos en Pubmed se puedan guardar para volver a utilizarlas posteriormente, por ejemplo si estamos haciendo una revisión en el tiempo y tenemos que ir recuperando los artículos que se incorporen a la base de datos.

Para guardar nuestras búsquedas utilizamos My NCBI. El primer paso es registrarnos, si aún no lo hemos hecho, en My NCBI con nuestro usuario y contraseña o vinculándolo a nuestra cuenta de correo de Google. Después lanzamos normalmente nuestra búsqueda en Pubmed y una vez que nos muestra los resultados, pinchamos en el link «Save Search» que aparece justo debajo del cuadro de búsqueda:

savesearch

El siguiente paso es nombrar esta búsqueda para identificarla posteriormente:

savesearchname

Hasta el momento, una vez que nombrábamos la búsqueda y la guardábamos, ésta no se podía modificar. A continuación os pongo una imagen de cómo se hacía hasta este momento y cómo se podrá hacer dentro de poco, cuando permitan modificar la estrategia de búsqueda al guardarla:

before-after

Como veis en la imagen derecha, el apartado «Search terms» se convertirá en una caja de texto editable. Esto permitirá modificar la búsqueda y comprobar que funciona pinchando en el link «Test search terms» antes de guardarla:

testsearch

Puedes completar esta información con el boletín técnico de la NLM:

http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma13/ma13_my_ncbi.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma13/ma13_my_ncbi.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma13/ma13_my_ncbi.html

Pubmed incorpora resúmenes en otros idiomas


Nuevos cambios en Pubmed. Dentro de poco se podrán enviar a Pubmed resúmenes en otros idiomas alternativos al inglés. Para poder acceder a ellos habrá que habilitar la opción Abstract en Display Settings.

Seleccionar Abstract de Display Settings.

Como sabéis, el formato por defecto para mostrar los resultados de Pubmed es Summary, lo que nos obliga a pinchar en cada título para poder leer el resumen correspondiente (si estuviera disponible). Si desde el principio se selecciona la opción Abstract podremos ver cada referencia con su resumen en la lista de resultados.

Los resúmenes adicionales en otros idiomas aparecerán en la opción Abstract (ver Figure 1). Por defecto siempre aparecerá el resumen en inglés acompañado de un enlace al resumen en el otro idioma (si existiere). Es importante tener en cuenta que la NLM no revisará estos resúmenes, pero pueden resultar de gran utilidad para facilitar la criba cuando estén escritos en nuestro idioma y tengamos problemas con el inglés.

resúmenes en otros idiomas

http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf13/jf13_pm_abstract.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf13/jf13_pm_abstract.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf13/jf13_pm_abstract.html

Novedades en el historial de Pubmed y en la barra de búsqueda


Dos actualizaciones más que sacará Pubmed en los próximos días.

    • En el apartado History. Como sabéis, para acceder al historial de búsquedas hay que pinchar en el enlace de «Búsqueda avanzada» que aparece debajo de la caja de búsqueda. Hasta ahora nos mostraba el historial de búsqueda de la siguiente forma:

      visualización actual de la opción History

      visualización actual de la opción History

      A la hora de recopilar nuestras búsquedas teníamos dos opciones. O guardar una búsqueda en nuestro perfil de MyNCBI (y en ese caso podíamos crear alertas o simplemente almacenarlas para reutilizarlas posteriormente) o copiarlas y pagarlas, «a mano», en un documento de texto para conservarlas. El problema de guardar las búsquedas en MyNCBI es que sólo puedes guardar una búsqueda, no toda la estrategia seguida. Sin embargo, se va a añadir una nueva funcionalidad a nuestro historial de búsqueda: «Download history«. Este enlace, que aparecerá en la parte superior derecha, junto al link «Clear history», nos permitirá descargar nuestro historial de búsquedas en formato .csv

      Próxima visualización de la opción History

      Próxima visualización de la opción History

       

  • En la barra de búsqueda: La barra de búsqueda está compuesta por el desplegable que permite seleccionar la base de datos de la NCBI y la caja de búsqueda propiamente dicha. Próximamente este desplegable se actualizará mostrando en primer lugar las cuatro últimas bases de datos utilizadas . Tras estas cuatro base de datos se mostrarán, como hasta ahora, el resto de bases de datos ordenadas alfabéticamente:

    Nueva forma de mostrar las bbdd utilizadas

    Se muestran las 4 últimas bbdd utilizadas

Más información:

Boletín técnico de la NLM
Boletín técnico de la NLM
Boletín técnico de la NLM

Cambios en Pubmed: los filtros sustituyen a la página de límites.


Una vez más, la NLM realiza cambios en la base de datos Pubmed. En esta ocasión no se trata de un cambio de diseño, sino de funcionalidad (que acarrea un nuevo diseño de pantalla, obviamente).

Hasta hace unos días, junto al cuadro de búsqueda de pubmed teníamos un enlace a los límites, que nos permitían acotar los resultados de búsqueda según nuestras necesidades. A partir de ahora, este enlace a la página de límites desaparece, convirtiéndose estos en parte de los filtros, que ahora se sitúan en un menú lateral en la parte izquierda de la pantalla.

A continuación, un antes y un después de la página principal de búsqueda:

ANTES: Limits

AHORA - sin limits

AHORA – sin limits

Sigue leyendo

Pubmed y MyNCBI añaden «favorites collection»


Pubmed ahora incluye una nueva característica dentro del formato de salida Abstract (en Display Settings). Esta característica está directamente relacionada con MyNCBI y si alguien quiere utilizarla sin haber iniciado sesión en MyNCBI le saltará directamente la pantalla de registro.

Para contaros esta nueva característica tomaré prestados los pantallazos con los que lo explican en el boletín técnico de la NLM:

«Favorites» es una nueva colección dentro de MyNCBI que permite a los usuarios guardar automáticamente una cita en la colección «favoritos»:

pubmed favorites

Cuando seleccionen el desplegable, además, podrán seleccionar la colección donde quieren guardarlo. También permite crear en el mismo momento una nueva colección. Estas nuevas colecciones se añadirán automáticamente a nuestra cuenta de MyNCBI:

pubmed favorites

Para desmarcar una colección elegida previamente, bastaría con marcar de nuevo la estrellita para quitar la selección (indicada con la estrella en azul).

Recordad que podéis modificar el nombre y el carácter público/privado de las colecciones dentro del apartado «Manage Collection» de MyNCBI.

http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma12/ma12_pm_favorites.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma12/ma12_pm_favorites.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma12/ma12_pm_favorites.html 

Tutorial de Pubmed.


Debido a estos cambios recientes de PubMed, la NLM ha actualizado el tutorial de PubMed de su página con las modificaciones realizadas hasta el 12 de diciembre de 2011. Podéis consultarlo aquí:

http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/

Novedades en PubMed: versiones de citas.


Versiones en PubMed: desde mediados de febrero, PubMed incluye las versiones de las citas:

Revisions, scientific updates, and updates of reviews are examples of content that could be versioned. Versions are not intended for correcting specific errors in an article, for which published errata notices should continue to be used.

El identificador PMID seguirá inalterable para un mismo documento, pudiendo utilizarse la notación «PMID.version» como identificador único para diferenciar entre diferentes versiones de un mismo documento. Todas las citas que no contengan una versión se considerarán como la primera. En el caso de que una de las versiones se eliminara, su número de versión se saltará, desapareciendo y recibiendo, la siguiente versión, el número correlativo a la versión eliminada.

Se pueden consultar las versiones en los formatos de salida Summary, Summary (text), Abstract, Abstract (text) (imágenes recogidas del boletín técnico de la NLM):

summary display
Summary Display

*-*-*-*-*-*

summary text
Summary text

*-*-*-*-*-*

Abstract display
Abstract display

*-*-*-*-*-*

Abstract text

Abstract text display

*-*-*-*-*-*

¿Cómo buscar por versiones?

Sólo la versión más reciente estará indizada en PubMed y será la que se devuelva al hacer una búsqueda por PMID. Para acceder a las versiones anteriores se puede buscar en el formato Abstract o utilizar alguna de las siguientes estrategias:

  • Buscar por una versión específica utilizando el formato PMID.versión (por ejemplo 20029611.1) en la caja de búsqueda de Pubmed. Se pueden utilizar operadores booleanos para buscar más de una versión.
  • Buscar todas las versiones de una cita introduciendo el formato PMID.* (por ejemplo 20029611.*) en la caja de búsqueda de Pubmed.
  • Buscar una versión específica añadiendo el número de versión al final de la url (por ejemplo: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20029611.1)

 

Más información:

http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf12/jf12_pm_versioning.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf12/jf12_pm_versioning.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf12/jf12_pm_versioning.html

Novedades en PubMed: Quality Improvement.


Como es habitual, la NLM está constantemente mejorando PubMed, añadiendo nuevas características, alguna modificación o eliminando detalles aparentemente sin importancia.

  • PubMed Queries: se añade la categoría «Quality Improvement» al apartado «Health Services Research» de las preguntas clínicas de PubMed. Esta nueva categoría viene a cubrir un área muy importante y demandada últimamente: la seguridad del paciente. El término «Quality Improvement» se añadió como término MeSH en el año 2011:

The new QI broad (sensitive) search query goes beyond the MeSH definition to retrieve studies that consider aspects of quality such as Clinical Competence, Outcomes and Process Assessment, Program Evaluation, Quality Indicators, and Quality Assurance. The new QI narrow (specific) search query retrieves studies that are methodologically rigorous and ready for application to practice and thus may not retrieve all studies relating to Quality Improvement. The purpose of these search queries is to help users quickly identify a set of relevant citations as a starting point, using the broad query when time allows or using the narrow query for a more manageable retrieval when there are time constraints. PubMed Related citations feature is useful for helping further identify relevant citations.

 

 

http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf12/jf12_hsr_pm_queries.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf12/jf12_hsr_pm_queries.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf12/jf12_hsr_pm_queries.html