Recopilación de Buscadores


Siguiendo en la línea de la entrada sobre wikis y recursos gratuitos a texto completo, os voy a dejar un listado (no entro en detalles) de buscadores. No están todos los que son, ni son todos los que están, ya que algunos podrían considerarse metabuscadores o herramientas de apoyo al portal al que pertenecen. De todas formas, si alguien conoce o se acuerda de alguno más, que nos envíe un comentario con el nombre del buscador y la dirección. Tened en cuenta que algunos de estos recursos requieren registro o suscripción.

Buscadores en Ciencias de la Salud:

MedLine/PubMed:

EBM y Revisiones:

Guías de Práctica Clínica:

Imágenes:

Para pacientes:

Medicamentos:

Congresos:

Radiología:

Descriptores:

Web of Knowledge:

Quertle (Beta): more semantic Medline search


Parece que la mañana va de buscadores. Consultando el blog de David Rothman descubro otro buscador de Medline. Ya habíamos hablado en este blog de GoPubMed y NovoSeek y ahora le toca el turno a Quertle.

logoquertle

Este buscador permite realizar búsquedas en Medline, utilizando “Power terms” para acotar los resultados de la búsqueda. El problema que yo le veo es que estos términos no se encuentran en la misma página, de manera que para seleccionarlos hay que pinchar en el enlace que se ofrece, de manera que “salta” una capa (tipo ventana emergente) con los términos y su definición. Esto puede estar bien, pero si necesitas uno que no aparece en este listado te dan la opción de consultar el listado completo, de manera que pierdes momentáneamente la página de búsqueda y tienes que utilizar el botón “retroceder” del navegador para volver.

Como apunta Rothman, que se resalten las relaciones del texto con el término buscado es una gran y buena idea. Tienes, por un lado, el número de artículos devueltos en la búsqueda y, además, el número de relaciones existentes. Para refinar los resultados también se pueden utilizar las opciones del menú de la derecha. O incluso acotar por autores o publicaciones.

Otro punto a tener en cuenta es que muestran el PMID del artículo recuperado, que abre en una ventana nueva la cita en PubMed. Echo de menos que indiquen el volumen, número y páginas donde se encuentra el artículo, ya que podría ahorrar el paso de tener que acudir a PubMed.

No he profundizado en el uso de esta herramienta, pero no me parece muy intuitiva a primera vista. Además, la presentación de los resultados no es cómoda y  no da ninguna opción para seleccionar los artículos que nos interesan y exportarlos ya sea a un archivo, a la impresora o por correo electrónico.

Además, como leo en el blog de Rothman -y compruebo por mí misma-, no se sabe quién está realmente detrás de este buscador, lo que quizás no da mucha confianza (al menos a mí). Y tampoco permite la búsqueda con operadores Booleanos (AND, OR, NOT), lo que facilitaría mucho las búsquedas. También es verdad que es un buscador en fase beta y que todo esto puede cambiar a mejor. Mientras tanto, creo que no va a ser una de mis herramientas de trabajo.

Cambios en PubMed (II)


El pasado 17 de noviembre de 2008 ya os adelantaba que PubMed iba a registrar varios cambios en su interfaz. Parece que estos cambios están a punto de ser una realidad definitiva. Bienvenidos -de nuevo- a la Búsqueda Avanzada de PubMed.

 

  • Limits, Preview/Index, History, Clipboard, Details:

Como os comentaba en la entrada de noviembre, las pestañas de  Limits, Preview/Index, History, Clipboard y Details desaparecerán de la página principal de PubMed.

La opción Clipboard pasará a ser un enlace visible debajo de la opción Búsqueda avanzada. Sólo podremos acceder a él si antes hemos guardado algún registro en el Clipboard.

La opción Details se convierte en un enlace dentro de la Búsqueda avanzada. Junto a él se ha añadido una interrogación, que enlaza con el apartado PubMed Help.

El resto de funcionalidades de las pestañas entrarán a formar parte de las opciones de Búsqueda avanzada.

 

  • Single Citation Matcher y Clinical Queries:

Otro cambio es el relacionado con Single Citation Matcher, que hasta ahora se puede encontrar en el menú azul de la izquierda en la página principal. Con los nuevos cambios, este enlace desaparecerá de aquí para poder consultarse en la Búsqueda avanzada, dentro de la opción Search by Author, Journal, Publication Date, and more, pinchando en el enlace Add More Citation Search Fields. Además, PubMed ha activado el Citation Sensor, de modo que si se da cuenta de que estás buscando una cita te mostrará, resaltadas en amarillo, un máximo de tres artículos que mejor coincidan con la cita buscada.

Las preguntas clínicas, Clinical Queries, a las que también se accede desde el menú situado en la parte izquierda de la pantalla, desaparecen para convertirse en un apartado más de la Búsqueda avanzada.

 

  • Iconos de Texto Completo:

Si os fijáis, esta opción ya ha desaparecido. Se trataba de tres tipos de iconos que indicaban si el artículo estaba disponible a texto completo (icono de una página verde), si sólo se disponía del abstract (icono de una página en blanco con 3 líneas) o si sólo se podía consultar el registro (icono de una página totalmente en blanco). Ahora, en el caso de que se pueda acceder al texto completo gratuito de ese artículo, se mostrará un enlace de color verde al final del registro.

 

  • Nuevo límite de edad:

Se ha creado un nuevo término que se incluirá en los límites por edad de la búsqueda avanzada. Se trata de Young Adult que representa las edades entre 19-24 años. Se añadirá efectivamente como límite (aún no aparece) cuando se añadan más artículos que cumplan con este requisito.

 

  • Resultados:

La forma de mostrar los resultados ha variado un poco: ahora se muestra primero el título, no como antes donde lo primero que se mostraban eran los autores del artículo.

En teoría también habrá cambios en Gene Sensor, Drug Sensor y Patient Sensor, pero no he conseguido probarlo (hace dos meses sí funcionaba), por lo que prefiero esperar antes de publicar la información. Eso sí, os dejo el enlace a la información que ofrece directamente el boletín técnico de la Biblioteca Nacional de Medicina de EEUU:

 

De todas formas recordad que PubMed no es la única herramienta para buscar en MedLine. Podéis utilizar la búsqueda que proporciona la plataforma de Ovid, GoPubMed, PubGet, SemanticMedLine, Novo|Seek

Os quiero dejar aquí un video-tutorial muy sencillo, de unos 7 minutos de duración, publicado en Liblog, el blog de las bibliotecas de la Clínica Mayo: PubMed Advanced Search: An Introduction.

     
    Error
    El video no existe

GoPubMed – facilitando las búsquedas


Con esta herramienta de búsqueda sobre la base de datos PubMed se puede ahorrar tiempo y esfuerzo a la hora de recuperar artículos relacionados sobre un tema.

GoPubMed es uno de los primeros buscadores de la Web 2.0 y ha sido desarrollado por la Universidad Técnica de Dresde, Alemania, en el grupo del Profesor Michael Schroeder en conjunto con Transinsight.

Es un buscador basado en ontologías, en conocimientos, por lo que las palabras clave de la búsqueda nos devuelven unos resultados clasificados según el MeSH (tesauro que cubre términos biomédicos y relacionados con la salud) y GeneOntology (vocabulario jerárquico sobre biología molecular).

Como casi todo en este mundo, se entenderá mejor si ponemos un ejemplo:

Si introducimos un término en la caja de búsqueda (por ejemplo “Aspirin“), GoPubMed es capaz de reconocer los conceptos ontológicos que aparecen en las publicaciones relacionadas con el término introducido. Los resultados se muestran a la derecha de la pantalla y a la izquierda tendremos las herramientas de navegación entre los conceptos relacionados (pinchar en la imagen para agrandar):

 

  • What: conceptos, términos, categorías.
  • Who: autores.
  • Where: revistas, internet…
  • When: fechas (los años más destacados o búsqueda por fecha concreta) 

 

GoPubMed sólo trabajará con los 1000 primeros registros que devolvería PubMed/MedLine, aunque te indica el número total de registros y te permite trabajar con todos ellos utilizando la búsqueda avanzada.

La primera opción que muestra es la posibilidad de ver los resultados (esos 1000 artículos) desde el punto de vista estadístico traducido a tablas y gráficos. Muestra también información sobre uno de los autores más destacados entre los resultados (1). La siguiente parte son los artículos recuperados en la búsqueda (2) (pinchar en la imagen para agrandar):

 

Una vez que hemos introducido el término “Aspirin” consideremos la pregunta “¿Qué procesos biológicos son inhibidos por la aspirina?” Para encontrar la respuesta tendríamos que volver al menú de la izquierda, dentro del apartado “What” y seleccionar “biological_process” (la “G” dentro del círculo nos indica que este descriptor pertenece al tesauro Gene Ontology). Al desplegarse podemos ver que la “vía de la ciclooxigenasa” está relacionada con este proceso. Si hacemos click en este proceso crearemos un filtro que nos devolverá sólo los artículos relacionados con la “vía de la ciclooxigenasa”. El segundo artículo contesta a nuestra pregunta.

Como se puede observar, el registro que nos devuelve tiene varios apartados:

  • Un clip que permite añadir/eliminar ese registro de nuestro bloc de notas
  • Un número (en este caso el 532) que se corresponde con su aparición en PubMed, es decir en la búsqueda PubMed nos habría devuelto este artículo en la posición 532 mientras que nosotros lo hemos recuperado en la segunda.
  • A la derecha del título del artículo tenemos el número PMID, que es un enlace a la referencia de este artículo en PubMed. “Related articles” permite encontrar artículos relacionados en GoPubMed.
  • Debajo del título tenemos el icono de una cabeza seguida por los nombres de los autores del artículo. Si pinchamos en uno de ellos obtendremos una búsqueda sobre ese autor.
  • También nos muestra la referencia completa del artículo, donde el título de la revista nos llevará a otros artículos de ese mismo número en GoPubMed.
  • A la izquierda del texto tenemos un icono. Si se pincha sobre él se despliega más información: posibilidad de leer el resumen completo, posibilidad de ver el documento en diferentes formatos y un tercer icono que podremos pinchar si creemos que el artículo que estamos visualizando no debería estar incluido aquí.
  • Además nos da información sobre términos que aparecen en el artículo, así como la afiliación de los autores y forma de contacto.