Novedades en el historial de Pubmed y en la barra de búsqueda


Dos actualizaciones más que sacará Pubmed en los próximos días.

    • En el apartado History. Como sabéis, para acceder al historial de búsquedas hay que pinchar en el enlace de «Búsqueda avanzada» que aparece debajo de la caja de búsqueda. Hasta ahora nos mostraba el historial de búsqueda de la siguiente forma:

      visualización actual de la opción History

      visualización actual de la opción History

      A la hora de recopilar nuestras búsquedas teníamos dos opciones. O guardar una búsqueda en nuestro perfil de MyNCBI (y en ese caso podíamos crear alertas o simplemente almacenarlas para reutilizarlas posteriormente) o copiarlas y pagarlas, «a mano», en un documento de texto para conservarlas. El problema de guardar las búsquedas en MyNCBI es que sólo puedes guardar una búsqueda, no toda la estrategia seguida. Sin embargo, se va a añadir una nueva funcionalidad a nuestro historial de búsqueda: «Download history«. Este enlace, que aparecerá en la parte superior derecha, junto al link «Clear history», nos permitirá descargar nuestro historial de búsquedas en formato .csv

      Próxima visualización de la opción History

      Próxima visualización de la opción History

       

  • En la barra de búsqueda: La barra de búsqueda está compuesta por el desplegable que permite seleccionar la base de datos de la NCBI y la caja de búsqueda propiamente dicha. Próximamente este desplegable se actualizará mostrando en primer lugar las cuatro últimas bases de datos utilizadas . Tras estas cuatro base de datos se mostrarán, como hasta ahora, el resto de bases de datos ordenadas alfabéticamente:

    Nueva forma de mostrar las bbdd utilizadas

    Se muestran las 4 últimas bbdd utilizadas

Más información:

Boletín técnico de la NLM
Boletín técnico de la NLM
Boletín técnico de la NLM

Iniciativa Web Content Collecting de la NLM de EEUU


Web Content Initiative

Cada día es mayor el conocimiento y los datos que se generan y comparten en Internet a través de las redes sociales y los blogs. La Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) de Estados Unidos reconoce la importancia de este hecho y por eso ha puesto en marcha la iniciativa Web Content Collecting. Se trata de recopilar, preservar y hacer accesible la literatura académica biomédica así como los recursos que ilustran una diversidad de puntos de vista filosóficos y culturales que no se pueden encontrar en literatura técnica.

La colección inaugural de esta iniciativa se llama «Health and Medicine Blogs» y presenta los puntos de vista de médicos, enfermeras, gestores de hospital y otros individuos relacionados con campos de la salud. También incluye crónicas narradas por los propios pacientes sobre sus experiencias en la vivencia de sus enfermedades.

With this initiative NLM has taken a major new step in its mission to collect pertinent health care information of today for the benefit of research in the future. Increasingly, that information is found on the Web, which is a rapidly changing environment where valuable and interesting materials can surface and then quickly disappear. The Library is working to ensure it can effectively collect new material in a Web environment, and guarantee the material’s permanence and availability to current and future patrons.

Para recoger la información web, la NLM ha contratado los servicios de Internet Archive. Aunque actualmente toda la información se encuentra almacenada en los servidores de IA, en el futuro se creará un repositorio dentro de la propia NLM.

En cuanto al copyright de estos sitios almacenados, los propios autores han dado permiso para el almacenamiento de su contenido, aunque los derechos finales siguen siendo de sus creadores y no de la institución que los almacena y preserva. Podéis leer más información sobre este tipo de derechos aquí.

Si tenéis dudas o queréis contactar directamente con la NLM sobre este proyecto, podéis enviarles un correo electrónico.

http://www.archive-it.org/collections/2722
http://www.archive-it.org/collections/2722
http://www.archive-it.org/collections/2722

Cambios en Pubmed: los filtros sustituyen a la página de límites.


Una vez más, la NLM realiza cambios en la base de datos Pubmed. En esta ocasión no se trata de un cambio de diseño, sino de funcionalidad (que acarrea un nuevo diseño de pantalla, obviamente).

Hasta hace unos días, junto al cuadro de búsqueda de pubmed teníamos un enlace a los límites, que nos permitían acotar los resultados de búsqueda según nuestras necesidades. A partir de ahora, este enlace a la página de límites desaparece, convirtiéndose estos en parte de los filtros, que ahora se sitúan en un menú lateral en la parte izquierda de la pantalla.

A continuación, un antes y un después de la página principal de búsqueda:

ANTES: Limits

AHORA - sin limits

AHORA – sin limits

Sigue leyendo

Pubmed y MyNCBI añaden «favorites collection»


Pubmed ahora incluye una nueva característica dentro del formato de salida Abstract (en Display Settings). Esta característica está directamente relacionada con MyNCBI y si alguien quiere utilizarla sin haber iniciado sesión en MyNCBI le saltará directamente la pantalla de registro.

Para contaros esta nueva característica tomaré prestados los pantallazos con los que lo explican en el boletín técnico de la NLM:

«Favorites» es una nueva colección dentro de MyNCBI que permite a los usuarios guardar automáticamente una cita en la colección «favoritos»:

pubmed favorites

Cuando seleccionen el desplegable, además, podrán seleccionar la colección donde quieren guardarlo. También permite crear en el mismo momento una nueva colección. Estas nuevas colecciones se añadirán automáticamente a nuestra cuenta de MyNCBI:

pubmed favorites

Para desmarcar una colección elegida previamente, bastaría con marcar de nuevo la estrellita para quitar la selección (indicada con la estrella en azul).

Recordad que podéis modificar el nombre y el carácter público/privado de las colecciones dentro del apartado «Manage Collection» de MyNCBI.

http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma12/ma12_pm_favorites.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma12/ma12_pm_favorites.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/ma12/ma12_pm_favorites.html 

Tutorial de Pubmed.


Debido a estos cambios recientes de PubMed, la NLM ha actualizado el tutorial de PubMed de su página con las modificaciones realizadas hasta el 12 de diciembre de 2011. Podéis consultarlo aquí:

http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/
http://www.nlm.nih.gov/bsd/disted/pubmedtutorial/

Novedades en PubMed: versiones de citas.


Versiones en PubMed: desde mediados de febrero, PubMed incluye las versiones de las citas:

Revisions, scientific updates, and updates of reviews are examples of content that could be versioned. Versions are not intended for correcting specific errors in an article, for which published errata notices should continue to be used.

El identificador PMID seguirá inalterable para un mismo documento, pudiendo utilizarse la notación «PMID.version» como identificador único para diferenciar entre diferentes versiones de un mismo documento. Todas las citas que no contengan una versión se considerarán como la primera. En el caso de que una de las versiones se eliminara, su número de versión se saltará, desapareciendo y recibiendo, la siguiente versión, el número correlativo a la versión eliminada.

Se pueden consultar las versiones en los formatos de salida Summary, Summary (text), Abstract, Abstract (text) (imágenes recogidas del boletín técnico de la NLM):

summary display
Summary Display

*-*-*-*-*-*

summary text
Summary text

*-*-*-*-*-*

Abstract display
Abstract display

*-*-*-*-*-*

Abstract text

Abstract text display

*-*-*-*-*-*

¿Cómo buscar por versiones?

Sólo la versión más reciente estará indizada en PubMed y será la que se devuelva al hacer una búsqueda por PMID. Para acceder a las versiones anteriores se puede buscar en el formato Abstract o utilizar alguna de las siguientes estrategias:

  • Buscar por una versión específica utilizando el formato PMID.versión (por ejemplo 20029611.1) en la caja de búsqueda de Pubmed. Se pueden utilizar operadores booleanos para buscar más de una versión.
  • Buscar todas las versiones de una cita introduciendo el formato PMID.* (por ejemplo 20029611.*) en la caja de búsqueda de Pubmed.
  • Buscar una versión específica añadiendo el número de versión al final de la url (por ejemplo: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20029611.1)

 

Más información:

http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf12/jf12_pm_versioning.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf12/jf12_pm_versioning.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf12/jf12_pm_versioning.html

Novedades en PubMed: Quality Improvement.


Como es habitual, la NLM está constantemente mejorando PubMed, añadiendo nuevas características, alguna modificación o eliminando detalles aparentemente sin importancia.

  • PubMed Queries: se añade la categoría «Quality Improvement» al apartado «Health Services Research» de las preguntas clínicas de PubMed. Esta nueva categoría viene a cubrir un área muy importante y demandada últimamente: la seguridad del paciente. El término «Quality Improvement» se añadió como término MeSH en el año 2011:

The new QI broad (sensitive) search query goes beyond the MeSH definition to retrieve studies that consider aspects of quality such as Clinical Competence, Outcomes and Process Assessment, Program Evaluation, Quality Indicators, and Quality Assurance. The new QI narrow (specific) search query retrieves studies that are methodologically rigorous and ready for application to practice and thus may not retrieve all studies relating to Quality Improvement. The purpose of these search queries is to help users quickly identify a set of relevant citations as a starting point, using the broad query when time allows or using the narrow query for a more manageable retrieval when there are time constraints. PubMed Related citations feature is useful for helping further identify relevant citations.

 

 

http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf12/jf12_hsr_pm_queries.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf12/jf12_hsr_pm_queries.html
http://www.nlm.nih.gov/pubs/techbull/jf12/jf12_hsr_pm_queries.html 

Actualizaciones realizadas por la NLM


NLM

Este post va a ser un resumen de los cambios o actualizaciones que se han producido en PubMed o Medline Plus durante el tiempo que no he publicado nada. Me dedicaré, simplemente, a señalar los cambios y dejaros un enlace al boletín técnico donde podréis ampliar más información.

  • PubMed Search Terms Bolded: Desde principios de julio se ha añadido esta característica a los resultados de las búsquedas de PubMed, que tiene como fin permitir a los usuarios una rápida localización de los términos utilizados con el uso de la negrita. Sólo está disponible en las opciones Summary y Abstract de los formatos de salida. Además de los términos utilizados, PubMed marcará en negrita aquellos que haya considerado oportunos para mejorar la búsqueda. Por ejemplo, una búsqueda con la palabra «cancer» nos marcará también «neoplasms». Recordad que desde MyNCBI seguís teniendo la opción de resaltar los términos de búsqueda.
  • Medline Plus RSS and Content Sharing Enhancements: Medline Plus ofrece ahora enlaces a RSS de cada uno de sus temas (incluidos los de Medline Plus en español). Los usuarios se pueden suscribir a los RSS de su interés según los temas desde la página de RSS de Medline Plus o directamente en cada tema. Para los usuarios hispanohablantes ofrecen un canal RSS con todos los enlaces de los temas de Medline Plus en español.
  • A Brand New Look for PubMed Central: Siguiendo la tendencia de unificar el diseño de las diferentes bases de datos que componen la NLM, PubMed Centralestrena nuevo diseño. En este caso os recomiendo visitar el boletín técnico para ver los cambios producidos, aunque es una web bastante intuitiva que, si ya estamos acostumbrados a utilizar PubMed, no será ningún problema. Y recordad que hay más de 2.2 millones de artículos disponibles gratuitamente a texto completo en PubMed Central.
  • PubMed, MeSH & NLM Catalog Search Boxes Modified: Para mejorar la accesibilidad de las páginas, se han reestructurado las cajas de búsqueda de estas bases de datos, de forma que los usuarios que utilizan fuentes diferentes al estándar no tengan problemas de visualización.
  • PubMed Clinical Queries Updated:  La página inicial de las Clinical Queries se modificó el pasado 16 de agosto para facilitar a los usuarios una comprensión más directa de cómo introducir la estrategia de búsqueda. También se ha actualizado la forma de mostrar las opciones de selección de los «Clinical Study Categories» y «Medical Genetics».

Entender el vocabulario médico


Understanding Medical Words: A Tutorial from the NLM (presentado en http://bibliovirtual.es)
This tutorial teaches you about medical words. You’ll learn about how to put together parts of medical words. You’ll also find quizzes to see what you’ve learned.

La Biblioteca Nacional de EEUU pone a disposición (en inglés) de toda la familia este tutorial en flash que pretende ayudar a comunicarse entre pacientes y médicos ya que, muchas veces, parece que hablemos distintos idiomas. Por ejemplo, para nosotros, pacientes, un «ataque al corazón» significa que el corazón se ha parado; para el médico, un ataque al corazón significa que ha habido daño en el músculo cardíaco.

Aunque sea sólo por curiosidad, os recomiendo que lo probéis. No existe versión en español, así que es necesario tener ciertos conocimientos en inglés para poder seguirlo, pero es fácil:

http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/medicalwords/
http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/medicalwords/
http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/medicalwords/

BabelMeSH


Leía en el blog de Azucena Santillán sobre BabelMeSH y me daba cuenta de que no os había hablado de esta opción en el blog. Muchas veces el problema de las búsquedas bibliográficas radica en el idioma. En Pubmed los títulos y los resúmenes de los artículos están traducidos al inglés, independientemente del idioma original en el que han sido publicados. Por este motivo, las búsquedas hay que hacerlas en inglés, pero muchas veces nos falta vocabulario técnico para traducir los descriptores MeSH. Hasta ahora siempre había recomendado la consulta al DECS, pero voy a empezar a incluir también BabelMeSH, página web perteneciente a la NLM americana y mantenida por el gobierno de EEUU:

Cuando se esta buscando información médica es más facil utilizar el idioma propio. La traducción del MeSH (descriptores o palabras clave de MEDLINE) podría ser de ayuda para las personas no muy familiarizadas con el inglés. Busque en MEDLINE/PubMed usando frases o términos médicos en español. Las citas y los resúmenes obtenidos estarán en inglés solamente. El uso de acentos es opcional.

Lo interesante de BabelMeSH es que además facilita realizar búsquedas en formato PICO. No dejéis de probarlo, creo que os puede resultar muy útil.

PICO en BabelMeSH

http://babelmesh.nlm.nih.gov/
http://babelmesh.nlm.nih.gov/
http://babelmesh.nlm.nih.gov/