Recopilación de Buscadores


Siguiendo en la línea de la entrada sobre wikis y recursos gratuitos a texto completo, os voy a dejar un listado (no entro en detalles) de buscadores. No están todos los que son, ni son todos los que están, ya que algunos podrían considerarse metabuscadores o herramientas de apoyo al portal al que pertenecen. De todas formas, si alguien conoce o se acuerda de alguno más, que nos envíe un comentario con el nombre del buscador y la dirección. Tened en cuenta que algunos de estos recursos requieren registro o suscripción.

Buscadores en Ciencias de la Salud:

MedLine/PubMed:

EBM y Revisiones:

Guías de Práctica Clínica:

Imágenes:

Para pacientes:

Medicamentos:

Congresos:

Radiología:

Descriptores:

Web of Knowledge:

Quertle (Beta): more semantic Medline search


Parece que la mañana va de buscadores. Consultando el blog de David Rothman descubro otro buscador de Medline. Ya habíamos hablado en este blog de GoPubMed y NovoSeek y ahora le toca el turno a Quertle.

logoquertle

Este buscador permite realizar búsquedas en Medline, utilizando “Power terms” para acotar los resultados de la búsqueda. El problema que yo le veo es que estos términos no se encuentran en la misma página, de manera que para seleccionarlos hay que pinchar en el enlace que se ofrece, de manera que “salta” una capa (tipo ventana emergente) con los términos y su definición. Esto puede estar bien, pero si necesitas uno que no aparece en este listado te dan la opción de consultar el listado completo, de manera que pierdes momentáneamente la página de búsqueda y tienes que utilizar el botón “retroceder” del navegador para volver.

Como apunta Rothman, que se resalten las relaciones del texto con el término buscado es una gran y buena idea. Tienes, por un lado, el número de artículos devueltos en la búsqueda y, además, el número de relaciones existentes. Para refinar los resultados también se pueden utilizar las opciones del menú de la derecha. O incluso acotar por autores o publicaciones.

Otro punto a tener en cuenta es que muestran el PMID del artículo recuperado, que abre en una ventana nueva la cita en PubMed. Echo de menos que indiquen el volumen, número y páginas donde se encuentra el artículo, ya que podría ahorrar el paso de tener que acudir a PubMed.

No he profundizado en el uso de esta herramienta, pero no me parece muy intuitiva a primera vista. Además, la presentación de los resultados no es cómoda y  no da ninguna opción para seleccionar los artículos que nos interesan y exportarlos ya sea a un archivo, a la impresora o por correo electrónico.

Además, como leo en el blog de Rothman -y compruebo por mí misma-, no se sabe quién está realmente detrás de este buscador, lo que quizás no da mucha confianza (al menos a mí). Y tampoco permite la búsqueda con operadores Booleanos (AND, OR, NOT), lo que facilitaría mucho las búsquedas. También es verdad que es un buscador en fase beta y que todo esto puede cambiar a mejor. Mientras tanto, creo que no va a ser una de mis herramientas de trabajo.

Otras formas de buscar en PubMed: novo|seek


novoseeklogo

novo|seek

En alguna ocasión anterior os había hablado de herramientas alternativas a la búsqueda en MedLine. Muchos de nosotros nos solemos centrar en el buscador de PubMed y olvidamos que hay otras herramientas que ofrecen resultados que podemos ajustar a nuestras necesidades. Una de estas herramientas es novo|seek, desarrollada por la empresa española Bioalma y disponible de forma gratuita en Internet. Las búsquedas hay que hacerlas en inglés, igual que pasa en PubMed, pero es muy fácil de utilizar y por sus resultados merece la pena probarla. Os explico un poco cómo funciona:

Podemos ver dos partes bien diferenciadas: la parte central donde vamos a ver los resultados de la búsqueda, y el menú de la parte izquierda que nos va a permitir definir nuestras búsquedas:

resultados1

Dentro de la opción “Show Search Details” podemos ver los artículos que ha devuelto nuestra búsqueda. La búsqueda del texto, en este caso “bronchiolitis”, nos devuelve  7309 documentos. Pero también nos dice que el término ha sido “mapped” y que esa búsqueda devuelve 2777 artículos. Cuando se “mapea” un término el sistema tiene en cuenta los términos biomédicos que ha detectado en los documentos recuperados, es decir, no se centra en que el término aparezca en el artículo, sino que devuelve artículos que hablen de ese tema (tiene en cuenta los sinónimos del término introducido).  Si pinchamos sobre la palabra que ha sido “mapeada” el sistema nos propone añadir este filtro a la búsqueda y restringir, así, un poco más los resultados de la búsqueda.

La segunda opción que podemos desplegar es “Highlight panel“, donde nos da la opción de marcar las “bioentidades“. Cada grupo está marcado en un color, por lo que si nosotros seleccionamos por ejemplo “Procedures and Techniques”, en los resultados obtenidos se nos va a resaltar en ese mismo color (morado) todos aquellos términos que hagan referencia a técnicas y procedimientos, como “lung transplantation” que aparece en el título del primer artículo devuelto.

Seguimos en la parte principal a la parte de Resultados. Vemos tres datos:

  • Medline: artículos recuperados de MedLine.
  • Full text: artículos disponibles gratuitamente a texto completo.
  • Grants: se refiere a los “US Awarded Grants”, son “becas” de investigación científica y permiten, por ejemplo, a un investigador saber lo que se está investigando en relación a su búsqueda.

El paso siguiente son los resultados, los artículos obtenidos. Hay 4 opciones de visualización y podemos seleccionarlas con los iconos Dibujo También se pueden ordenar los resultados por relevancia y fecha.

Los Filtros. Este apartado, situado en el menú de la izquierda, quizás sea lo más interesante de esta herramienta.

filtros Cuando realizamos una búsqueda en novo|seek en la página de resultados se crea un “perfil de conceptos relacionados“. Están organizados en “bioentidades“, que a su vez agrupan los términos complementarios -ordenados por relevancia- a la búsqueda realizada previamente. Cada uno de estos términos o conceptos puede ser un filtro para afinar más nuestra búsqueda y hacerla así más específica, de modo que somos nosotros quienes decidimos el grado de precisión de los resultados obtenidos. Podemos añadir cuantos filtros deseemos, y podemos también eliminarlos para adecuar los resultados a nuestras necesidades.

Cada vez que añadimos un filtro, igual que pasaba en el desplegable “Highlight panel”, en nuestros resultados se señalan los términos relacionados con ese filtro.

A la derecha de cada concepto me aparece una barra que me indica la relevancia de ese concepto según mi búsqueda y que me puede ayudar a seleccionar el filtro que más me interese en función de la relevancia de los términos.

Todo esto que os he explicado forma parte de la búsqueda sencilla de novo|seek, pero también tenemos la opción de realizar una búsqueda avanzada donde podremos determinar más criterios de búsqueda, como el rango donde quiero hacer la búsqueda (“corpus”: medline, full text o grants), campos donde quiero buscar los términos; palabras o frases; buscar por entidades específicas, autores o publicaciones; fechas de publicación.

bavanzada

Para terminar, me gustaría comentaros que novo|seek se encuentra muy presente en la web 2.0. Tienen cuenta en Twitter/novoseek, en Facebook, una plataforma dedicada a los comentarios y sugerencias de los usuarios, y un apartado con videos demostrativos.

Cambios en PubMed (II)


El pasado 17 de noviembre de 2008 ya os adelantaba que PubMed iba a registrar varios cambios en su interfaz. Parece que estos cambios están a punto de ser una realidad definitiva. Bienvenidos -de nuevo- a la Búsqueda Avanzada de PubMed.

 

  • Limits, Preview/Index, History, Clipboard, Details:

Como os comentaba en la entrada de noviembre, las pestañas de  Limits, Preview/Index, History, Clipboard y Details desaparecerán de la página principal de PubMed.

La opción Clipboard pasará a ser un enlace visible debajo de la opción Búsqueda avanzada. Sólo podremos acceder a él si antes hemos guardado algún registro en el Clipboard.

La opción Details se convierte en un enlace dentro de la Búsqueda avanzada. Junto a él se ha añadido una interrogación, que enlaza con el apartado PubMed Help.

El resto de funcionalidades de las pestañas entrarán a formar parte de las opciones de Búsqueda avanzada.

 

  • Single Citation Matcher y Clinical Queries:

Otro cambio es el relacionado con Single Citation Matcher, que hasta ahora se puede encontrar en el menú azul de la izquierda en la página principal. Con los nuevos cambios, este enlace desaparecerá de aquí para poder consultarse en la Búsqueda avanzada, dentro de la opción Search by Author, Journal, Publication Date, and more, pinchando en el enlace Add More Citation Search Fields. Además, PubMed ha activado el Citation Sensor, de modo que si se da cuenta de que estás buscando una cita te mostrará, resaltadas en amarillo, un máximo de tres artículos que mejor coincidan con la cita buscada.

Las preguntas clínicas, Clinical Queries, a las que también se accede desde el menú situado en la parte izquierda de la pantalla, desaparecen para convertirse en un apartado más de la Búsqueda avanzada.

 

  • Iconos de Texto Completo:

Si os fijáis, esta opción ya ha desaparecido. Se trataba de tres tipos de iconos que indicaban si el artículo estaba disponible a texto completo (icono de una página verde), si sólo se disponía del abstract (icono de una página en blanco con 3 líneas) o si sólo se podía consultar el registro (icono de una página totalmente en blanco). Ahora, en el caso de que se pueda acceder al texto completo gratuito de ese artículo, se mostrará un enlace de color verde al final del registro.

 

  • Nuevo límite de edad:

Se ha creado un nuevo término que se incluirá en los límites por edad de la búsqueda avanzada. Se trata de Young Adult que representa las edades entre 19-24 años. Se añadirá efectivamente como límite (aún no aparece) cuando se añadan más artículos que cumplan con este requisito.

 

  • Resultados:

La forma de mostrar los resultados ha variado un poco: ahora se muestra primero el título, no como antes donde lo primero que se mostraban eran los autores del artículo.

En teoría también habrá cambios en Gene Sensor, Drug Sensor y Patient Sensor, pero no he conseguido probarlo (hace dos meses sí funcionaba), por lo que prefiero esperar antes de publicar la información. Eso sí, os dejo el enlace a la información que ofrece directamente el boletín técnico de la Biblioteca Nacional de Medicina de EEUU:

 

De todas formas recordad que PubMed no es la única herramienta para buscar en MedLine. Podéis utilizar la búsqueda que proporciona la plataforma de Ovid, GoPubMed, PubGet, SemanticMedLine, Novo|Seek

Os quiero dejar aquí un video-tutorial muy sencillo, de unos 7 minutos de duración, publicado en Liblog, el blog de las bibliotecas de la Clínica Mayo: PubMed Advanced Search: An Introduction.

     
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