Nuevo filtro en PubMed y PMC


Cuando se realiza una búsqueda en PubMed o en PMC tenemos la opción de usar los filtros que aparecen por defecto en la parte izquierda de la pantalla. Los filtros permiten acotar los resultados para eliminar el mayor número de documentos no relevantes del conjunto de referencias recuperadas, es decir, no se deben aplicar sólo para reducir un número excesivo de resultados.

Pero también podemos aplicar estos filtros para recuperar subconjuntos que cumplan un criterio específico que nos interese o que nos pueda ayudar con nuestra investigación. Para ello, ahora PubMed y PMC nos ofrecen nuevos filtros.

Los filtros permiten acotar los resultados para eliminar el mayor número de documentos no relevantes del conjunto de referencias recuperadas

PubMed ofrece la opción data[filter] para acotar los resultados por aquellos que disponen de enlaces externos a información relacionada tanto en el campo Secondary Source ID on en el campo Link Out-Other Literature Resources. Estos enlaces pueden ser a otras bases de datos de la NLM o a repositorios de datos externos como Figshare.

El modo de uso de este filtro es muy fácil: desde el apartado filtros del menú lateral izquierdo, podemos localizarlo en el apartado Search Fields (donde, por cierto, ya desapareció el 1 de abril la opción de PubMed Commons); pero también lo podemos escribir a mano usando la expresión data[filter] en nuestra búsqueda.

PMC ofrece tres tipos diferentes de filtros:

  • has suppdata[filter] para localizar artículos con material suplementario
  • has data avail[filter] para localizar artículos que incluyen información sobre la disponibilidad de datos o declaración sobre la accesibilidad de esos datos
  • has data citations[filter] para localizar artículos que incluyen información sobre citas
  • has associated data[filter] sería el filtro que se puede usar de manera alternativa para recuperar información de cualquiera de los tres filtros anteriores.

Al igual que en PubMed, los filtros en PMC se pueden localizar en el menú lateral izquierdo o se pueden incluir directamente como expresiones en nuestra estrategia de búsqueda.

PubMed: (“diabetes mellitus”[MeSH Terms] AND data[filter])

PMC: (“diabetes mellitus”[MeSH Terms] AND has suppdata[filter])

Como podemos observar, los filtros de PMC son mucho más específicos que el de PubMed, que engloba mucha más información.

 

Si esta información te ha resultado útil y crees que en tu institución sería buena idea que yo os diera un curso de formación sobre búsquedas bibliográficas en PubMed, ponte en contacto conmigo para pedir presupuesto (tus datos no se almacenarán ni tratarán de ninguna forma, sólo se utilizarán para ponernos en contacto contigo en relación al tema del formulario):

Novedades en los resultados de búsqueda en PMC


PubMed Central, que cambió su nombre a PMC hace un tiempo, acaba de introducir otro cambio mucho más interesante: los filtros, del estilo a PubMed, en sus resultados de búsqueda.

PMC es un archivo gratuito de artículos a texto completo localizados en revistas de ciencias de la vida y biomédicas. Se encuentra alojado en los servidores de los US NIH/NLM (National Institutes of Health’s National Library of Medicine). PMC provee acceso gratuito a artículos de revistas que depositan su contenido en este archivo, aunque el uso de estos artículos sigue regido por leyes de copyright. También incluye manuscritos remitidos por autores y que han sido revisados por pares.

Hasta ahora, los resultados de una búsqueda en PMC se mostraban como un listado simple. Desde este mes de agosto se han incluido filtros en la parte izquierda de la pantalla, de igual forma que los podemos encontrar en PubMed. Y funcionan de la misma manera:

Filtros PMC - ejemplo

Se puede acotar el resultado de la búsqueda usando los filtros de disponibilidad del texto, fecha de publicación, campos de búsqueda, organizaciones que financian una investigación (research funder) o características del artículo (se refiere al tipo de material que representa el artículo: manuscritos de autor, archivos añadidos como parte del proyecto PMC Back Issue Digitization, Open Access o artículos retractados.

Cada vez que queremos aplicar un filtro tendremos que marcarlo y, de esa forma, lo activaremos. Tenemos que tener en cuenta que ese filtro, igual que pasa en PubMed, quedará activo para las siguientes búsquedas. Debemos desmarcarlo si no queremos que se aplique en las siguientes búsquedas que realicemos. Para ello podemos eliminar el filtro uno a uno o bien pinchando en el enlace Clear all para eliminarlos todos de golpe. Si somos usuarios de MyNCBI podemos además utilizar los filtros personalizados que tengamos almacenados en nuestro perfil.

Otro cambio interesante en los resultados de búsqueda es que ahora, si un artículo ha sido retractado, se marca en rojo y se incluye un enlace, de manera que sea más fácil para el usuario llevar un seguimiento y ver fácilmente las actualizaciones posteriores de una publicación o de una investigación.

retracted in PMC

Acceso a PMC:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc

PubReader, una nueva forma de leer artículos en la tablet


PubMed Central (ya expliqué aquí qué es PubMed Central) acaba de presentar una característica nueva para visualizar mejor los artículos desde los dispositivos móviles: PubReader Muchos de nosotros utilizamos más este tipo de dispositivos (smartphones, tabletas) para consultar Internet antes que el propio ordenador. Y también sabemos, por esto mismo, que la visualización en estas pantallas no es igual que la que se pueda hacer desde un monitor.

pubreader en pubmedcentral

pinchar para agrandar

 

PubReader es una alternativa al pdf que permite leer los artículos directamente en la pantalla, permitiendo navegar por los diferentes apartados del artículo (resumen, introducción, material y métodos, resultados, pie de página…), ver con detalle las tablas, figuras e imágenes, configurar el tamaño de la letra y seleccionar visualización del texto a una o dos columnas.

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Actualizaciones realizadas por la NLM


NLM

Este post va a ser un resumen de los cambios o actualizaciones que se han producido en PubMed o Medline Plus durante el tiempo que no he publicado nada. Me dedicaré, simplemente, a señalar los cambios y dejaros un enlace al boletín técnico donde podréis ampliar más información.

  • PubMed Search Terms Bolded: Desde principios de julio se ha añadido esta característica a los resultados de las búsquedas de PubMed, que tiene como fin permitir a los usuarios una rápida localización de los términos utilizados con el uso de la negrita. Sólo está disponible en las opciones Summary y Abstract de los formatos de salida. Además de los términos utilizados, PubMed marcará en negrita aquellos que haya considerado oportunos para mejorar la búsqueda. Por ejemplo, una búsqueda con la palabra “cancer” nos marcará también “neoplasms”. Recordad que desde MyNCBI seguís teniendo la opción de resaltar los términos de búsqueda.
  • Medline Plus RSS and Content Sharing Enhancements: Medline Plus ofrece ahora enlaces a RSS de cada uno de sus temas (incluidos los de Medline Plus en español). Los usuarios se pueden suscribir a los RSS de su interés según los temas desde la página de RSS de Medline Plus o directamente en cada tema. Para los usuarios hispanohablantes ofrecen un canal RSS con todos los enlaces de los temas de Medline Plus en español.
  • A Brand New Look for PubMed Central: Siguiendo la tendencia de unificar el diseño de las diferentes bases de datos que componen la NLM, PubMed Centralestrena nuevo diseño. En este caso os recomiendo visitar el boletín técnico para ver los cambios producidos, aunque es una web bastante intuitiva que, si ya estamos acostumbrados a utilizar PubMed, no será ningún problema. Y recordad que hay más de 2.2 millones de artículos disponibles gratuitamente a texto completo en PubMed Central.
  • PubMed, MeSH & NLM Catalog Search Boxes Modified: Para mejorar la accesibilidad de las páginas, se han reestructurado las cajas de búsqueda de estas bases de datos, de forma que los usuarios que utilizan fuentes diferentes al estándar no tengan problemas de visualización.
  • PubMed Clinical Queries Updated:  La página inicial de las Clinical Queries se modificó el pasado 16 de agosto para facilitar a los usuarios una comprensión más directa de cómo introducir la estrategia de búsqueda. También se ha actualizado la forma de mostrar las opciones de selección de los “Clinical Study Categories” y “Medical Genetics”.

Cómo buscar los datos completos de un artículo (1ª parte: SCM)


Vamos a hacer una serie de entradas del estilo a Barrio Sésamo.

Hoy os vamos a enseñar a buscar los datos completos de un artículo con el Single Citation Matcher de PubMed.

¿Por qué? Porque está muy feo solicitar un artículo con datos incompletos o, lo que es peor, incorrectos.

¿Por qué? Porque si tienes todos los datos del artículo podrás saber si desde tu biblioteca tienes acceso al texto completo o simplemente es un artículo de acceso libre y así ahorrarte el tiempo de espera a que te lo envíen.

¿Por qué? Porque así ahorrarás tiempo en el futuro cuando busques bibliografía y no cuentes con la ayuda de un experto.

Bueno, por ahora esas tres razones son suficientes para empezar. En próximos post daremos más ideas o trucos.

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Criterios de indexación de una e-revista en MedLine


Cuando los cambios se producen para generar mejoras podemos pensar que la cosa funciona y tiene futuro. Afortunadamente es lo que pasa con los productos que desarrolla la NLM de Estados Unidos. Recientemente han actualizado los requisitos que han de cumplir las revistas electrónicas que quieran ser indexadas en MedLine.

En principio, esta nueva política se aplicará exclusivamente a las revistas que, habiendo solicitado y sido aprobada su inclusión en MedLine, publiquen su contenido exclusivamente online y, con el tiempo, se ampliará a aquellas revistas que, aun teniendo edición impresa, publiquen el grueso de sus contenidos en formato electrónico.

Las tres condiciones indispensables que ha de cumplir una revista electrónica para ser indexada en MedLine son:

  1. Proporcionar a la NLM un documento XML con la información etiquetada de las referencias bibliográficas
  2. Facilitar el acceso a todo su contenido bajo una licencia que permita un apoyo eficiente a las operaciones de la NLM, los servicios del sitio y el préstamo interbibliotecario.
  3. Tener un acuerdo aceptable de conservación permanente y acceso a los contenidos publicados.

Para el cumplimiento de los puntos 2 y 3, la NLM se tiene que asegurar de que todos los artículos publicados en una revista electrónica estarán disponibles en un archivo digital. Con esto pretenden asegurar que todos los usuarios podrán tener acceso al texto completo de los artículos citados en MedLine. Esto se puede conseguir mediante una de estas dos opciones:

  • La participación en PubMed Central
  • La participación de cualquier otro servicio certificado de almacenamiento de archivos, además de la presentación de un archivo pdf por cada artículo que será de uso exclusivo para las operaciones internas de la NLM.

Esta política se aplicará a partir de mayo de 2011.

Me gusta la frase que os he señalado en negrita. Y es que los que necesitamos localizar artículos a diario encontramos una gran diferencia entre contar o no con un enlace directo desde Pubmed a la fuente. El hecho de que estén publicados en PMC además suele ser garante de un acceso gratuito al artículo, lo que es también motivo de alegría (recordad este post que publiqué sobre PMC).

Podéis leer más información sobre la política de indexación de revistas electrónicas en Medline en la siguiente dirección:

http://www.nlm.nih.gov/services/ejournals.html
http://www.nlm.nih.gov/services/ejournals.html
http://www.nlm.nih.gov/services/ejournals.html