PubMed Commons desaparece


En 2013 os anunciaba un proyecto piloto de PubMed: PubMed Commons. La idea era facilitar la conversación entre autores, permitiendo los comentarios en los artículos indexados en PubMed. Con esto se pretendía agilizar el intercambio de información evitando los tiempos de espera si alguien quería publicar un comentario a un artículo. También podía servir al resto de autores/investigadores para saber si un tema era interesante para la comunidad y cuál era la tónica general, lo que podía facilitar la decisión de seguir investigando o replicando estudios.

Hoy nos anuncian que PubMed Commons dejará de funcionar este mes. Os añado la comunicación:

PubMed Commons has been a valuable experiment in supporting discussion of published scientific literature. The service was first introduced as a pilot project in the fall of 2013 and was reviewed in 2015. Despite low levels of use at that time, NIH decided to extend the effort for another year or two in hopes that participation would increase. Unfortunately, usage has remained minimal, with comments submitted on only 6,000 of the 28 million articles indexed in PubMed.

While many worthwhile comments were made through the service during its 4 years of operation, NIH has decided that the low level of participation does not warrant continued investment in the project, particularly given the availability of other commenting venues.

The discontinuation plan is as follows:

  • New comments will be accepted through February 15, 2018.
  • Comments will continue to be visible on the PubMed and PubMed Commons websites through March 2, 2018.
  • Users wishing to access the comments after March 2, 2018, will be able to download them from NCBI’s website.

Many thanks to all of you who participated in this experimental effort to enhance the opportunities for interaction about published biomedical literature.

Suponemos que este cambio conllevará a su vez otro rediseño de la home de PubMed, ya que ahora una de las columnas estaba dedicada exclusivamente a los comentarios dejados por los autores:

desaparece pubmed commons

 

Como veis en la nota del NIH, aún podréis acceder a los comentarios desde PubMed y desde la web de PubMed Commons hasta el 2 de marzo de este año.

PubMed Commons

Me gusta PubMed Labs porque siempre está probando cosas interesantes. Algunas siguen para adelante, otras desaparecen, pero esto demuestra que las bases de datos como meros espacios (virtuales) de almacenamiento de la información forman parte del pasado. Apuesto que en un futuro cercano las búsquedas en PubMed se basarán en NLP (Natural Language Processing) y en Inteligencia Artificial. Pero mientras siga como hasta ahora, si no sabes usar los descriptores Mesh, te recomiendo que acudas a tu bibliotecaria de cabecera si quieres ahorrar tiempo y hacer búsquedas eficientes.

Nueva característica de PubMed: “PubMed Also-Viewed”


PubMed is free, but finding the important articles on a topic can cost a lot of time.

Cuando estás en cualquier web de compras, por ejemplo, es habitual ver mensajes del tipo “los usuarios/clientes que compraron este producto también se interesaron por este/estos otro/s”. Ahora PubMed quiere ayudar a sus usuarios con un nuevo enlace llamado “Articles frequently viewed together” y que, basándose en los click hechos por otros usuarios durante el año anterior, identifica los artículos que se leen relacionados entre sí. El hecho de que el algoritmo utilizado esté basado en los clicks hechos durante el año inmediatamente anterior implica que los artículos antiguos están pobremente representados. De hecho, de los más de 24 millones de registros que contiene PubMed, sólo 1,3 millones dispone de este link. alsoviewed

¿Cómo lo vemos? Pincha en el título del artículo para leer su resumen. En la columna de la derecha verás un apartado que dice “Related information” y el enlace “Articles frequently viewed together”. Si el artículo no tiene otros registros relacionados por consulta no aparecerá nada. Si queréis hacer una búsqueda y que en los resultados aparezcan sólo artículos con registros vinculados por la consulta deberéis introducir pubmed_pubmed_alsoviewed[filter] en la estrategia de búsqueda. Por ejemplo, para buscar artículos que hablen sobre la diabetes melitus y tengan artículos que se consulten juntos:

“Diabetes Mellitus”[Mesh] AND pubmed_pubmed_alsoviewed[filter]

Es importante no confundir el enlace “Similar articles” que aparece al final de cada referencia de PubMed con la nueva característica “Also viewed”. Los artículos similares están basados en un algoritmo donde se tienen en cuenta los términos Mesh y las palabras clave y su ubicación dentro del texto entre otras cosas.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed